Fatih Hilmioğlu 1954 Yılında Elbistan, Kahramanmaraş’ta doğdu. 1972 Yılında Ankara Cumhuriyet Lisesini bitirdi. 1979 Yılında Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesinden mezun oldu.
İç Hastalıkları Uzmanlık eğitimini 1980-1985 yılları arasında Almanya Hoya Hastanesi ve Essen Üniversitesi Tıp Fakültesi İç Hastalıkları Anabilim Dalında yaptı. Uzmanlık unvanını 14.05.1986 da Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi İç Hastalıkları Anabilim Dalında girerek aldı.
1987-1990 Yılları arasında Ankara Yüksek İhtisas Hastanesinde Gastroenteroloji Yan DalUzmanlığı için ihtisas yaptı. 1990-1992 Yılları arasında Yüksek İhtisas Hastanesi Gastroenteroloji Başasistanlığını yaptı. 16.10.1991 Yılında İç Hastalıkları Anabilim Dalı Gastroenteroloji Bilim Dalından Doçentlik Unvanını aldı. 13.03.1997 Yılında İç Hastalıları Anabilim Dalı Profesörlüğüne atandı. 1996-1998 yılları arasında 2 yıl süre ile Turgut Özal Tıp Merkezi Başhekimliğini yaptı. 26.1.1998- 30.6.1998 tarih1eri arasındaTıp Fakültesi Dekan yardımcılığı ve Dekan Vekilliği yaptı.
30 Haziran 1998 tarihinde Tıp Fakültesi Dekanlığına atandı. 1992 Yılından beri Malatya da görev yapan ve Gastroenteroloji kliniğini kuran Prof.Dr.Fatih Hilmioğlu, Tıp Fakültesi Fakülte Kurulu ve Fakülte Yönetim kurulu üyeliklerinde bulundu. 29 ü Uluslar arası olmak üzere dergilerde 80 makalesi ve 150 tebliği bulunmaktadır. Çok sayıda Ulusal ve uluslararası kongerelerde panelist ve oturum başkanlığı yaptı. Almanca ve İngilizce bilmekte olan Dr.Hilmioğlu evli ve 2 çocuk sahibidir.
İnönü Üniversitesi eski rektörü olan Fatih Hilmioğlu Ergenekon Davası’ndan 23 yıl hapis cezasına çarptırılmıştı ve 5 yıldır Silivri Cezaevi’nde tutukluydu.